坏处在于文化课分数低，导致进高中后的学习可能会跟不上。如果体育特长生上高中后，高中成绩没有优势，考大学时还可能面临走纯高考只能进一般大学，走艺体专业选择面又较窄等问题，陷入被动局面。

初中特长生就是体音美比较突出的学生，这类学生，文化课基础差，如果将他们编入平行班，影响班级的平均分，甚至在某些情况下还会影响课堂纪律。所以，招收特长班的学校都是将特长生单独编班，不和普通班学生放一块。

其次，初中特长生到高中后，选择面比较窄，可能会影响高中的升学率。

初中特长生把大量时间用到了特长培训和练习上，忽视了基础文化知识的学习。这对于初中生过渡到高中以后的科学文化知识的汲取不利，还越来越消磨了孩子进步的自信心。