函授大专学籍档案丢失，一般情况下，学历仍然是被承认的。

不过，如果需要用到档案，会比较麻烦。因为档案丢失后，学历的具体信息可能无法查证。如果需要补办档案，可以向原来就读的学校申请补办。需要填写一份档案补办申请表，提供个人身份证件和学历证明等相关材料。然后按照学校的规定进行补办手续，如提交申请表、缴纳补办费用等。具体流程可能因学校而异，建议向学校咨询。此外，如果是在工作单位丢失了档案，可以向单位的人事部门申请补办。同样需要填写申请表，提供个人身份证件和学历证明等相关材料。然后按照单位的流程进行补办手续。总之，函授大专学籍档案丢失后，学历仍然是被承认的。如果需要用到档案，建议及时向学校或工作单位申请补办。