古巨基的祖籍是现地址是广东省茂名高州市荷花镇大路山村委会高山村。

他的爷爷是广州黄埔陆军军官学校毕业生，参加过抗日战争。他父亲是高州当地一名教师，1966年移居香港。古巨基一直秉承着“忠厚传家承亶父，义方教子学燕山”的祖训，为人处事都处处充满忠孝仁义礼智信。