硕士毕业论文被抽检会查的问题主要包括原创性、规范性、研究质量、论文内容以及一些基础内容。

原创性：这是抽检中最受关注的一个方面。论文应具有较高的原创性，不存在抄袭、剽窃等学术不端行为。如果发现抄袭现象或未能正确标注引用他人观点或数据，将构成学术不端行为1。规范性：包括文献引用、参考文献、实验方法等部分的格式规范。论文在格式上存在的问题，如参考文献格式不统一、引用文献不规范等，会影响论文的整体质量和可读性1。研究质量：涉及研究方法是否科学合理，数据分析是否准确可靠，结论是否具有可信度和创新性。存在问题的论文在研究方法和数据分析上可能不科学、不严谨，导致结论缺乏可信度和创新性1。