日本留学直读大学包括但不限于以下几所：

东京地区

京都大学：日本最古老的国立大学之一，以深厚的学术积淀和丰富的研究设施闻名。

早稻田大学：著名的私立大学，以国际化的视野和多元化的学科设置受到青睐。

庆应义塾大学：在人文社科领域有卓越成就的私立名校。

东京工业大学：在工程技术领域享有盛誉，是日本顶尖的理工科大学。

大阪~京都及名古屋地区

京都大学：同东京大学齐名，是日本另一所顶尖国立大学。

名古屋大学：位于名古屋，是日本中部地区的重要高等教育机构。

神户地区

其他地区

北海道大学：位于札幌，是日本最北端的一所国立大学，历史悠久。

九州大学：位于福冈，是日本南部的重要高等教育机构。

以上信息包含了部分日本顶尖的国立和私立大学，它们在各自的领域有着卓越的教学和研究水平。选择留学日本时，可以根据自己的兴趣和目标选择合适的大学和专业。