日本留学签证的注销流程通常包括以下几个步骤：

确认离境：

在离开日本的前一天，向宿舍或房东及学校确认离境事实，并取得“自愿离境证明书”。

外院申请：

拿到离境证明书后，需要向外国人注册处提出“外国人退去登记”申请，所需材料包括离境证明书、留日印章登记证明、通知免签等。

入国管理局申请：

外国人注册处受理后，需前往入国管理局进行申请，所需材料包括：在留卡、离境证明书、外国人退去登记证明书。

销签手续：

在入国管理局完成相关手续后，拿到手续批准文件即可进行销签。

另外，根据日本领事馆的要求，回国后一个月内需要提交以下文件进行销签：

归国报告书

护照首页

护照签证页

出入境4个章页扫描件

请注意，以上信息可能随时间变化，建议在办理销签前，向日本领事馆或相关机构确认最新的销签要求和流程。