日本留学申请护照的流程通常包括以下几个步骤：

准备材料

有效的身份证明文件（如身份证或户口本）。

留学申请表。

入学通知书。

语言能力证明。

资金证明。

前往办理地点

前往户口所在地的公安局出入境管理处。

办理流程

排队拍照。

填写申请表。

提交申请表、身份证、照片及拍照回执。

交验身份证。

支付申请费用。

领取护照回执。

注意事项

护照照片要求通常为近期免冠照片，具体尺寸和背景要求请遵循当地公安局出入境管理处的规定。

首次申请护照的费用大约为200元人民币，具体费用可能因地区而异。

护照的有效期通常为10年。

如果是在外地上学或工作，可以咨询当地公安局出入境管理处了解是否可以就近办理。

以上步骤和注意事项可以作为参考，具体流程和要求可能因地方公安局出入境管理处的规定有所变化，请以当地实际情况为准。