补办日本留学签证的时间可能因具体情况而异，但根据最近的信息，以下是一般的时间框架：

领事馆补办

一般需要15个工作日。

可以申请加急服务，但具体情况需咨询领事馆。

大使馆补办

一般情况下，加急服务可以实现立等可取。

最近的信息显示，东京使馆的护照办理大约需要十个工作日，加上周末约15天可以到手。

补办流程

遗失或被偷后，需向学校汇报情况并开具证明，然后到大使馆重新办理签证。

留学生应先到警察局报失并获取报失证明，再向大使馆提交补办申请。

请注意，这些信息可能会随着时间和政策的变化而变化，建议直接联系最近的日本大使馆或领事馆获取最新的补办时间和流程信息。