日本留学本科可以选择的知名院校包括：

东京大学

主要院系：法学、医药、工程、信息、科学、农业、经济学、艺术与科学等。

京都大学

主要院系：文学、法学、理学、医学、药学、工学、农学、教育学、经济学等。

东京工业大学

主要院系：工学、理学。

大阪大学

主要院系：文学、法学、经济学、理学、工学、药学、医学、牙科学等。

东北大学

主要院系：文学系、教育学院、法学系、经济系、理学部、医学系、口腔系等。

庆应义塾大学

以人文社科领域的卓越成就闻名。

早稻田大学

以国际化的视野和多元化的学科设置受到青睐。

青山学院大学

知名私立大学之一。

北海道大学

位于札幌，是日本最北端的一所国立大学，历史悠久。

九州大学

位于福冈，是日本南部的重要高等教育机构。

此外，还有如 横滨国立大学、 早稻田大学、 东京福祉大学、 日本经济大学等也是不错的选择。

选择留学日本时，学生可以根据自己的兴趣和目标选择合适的大学和专业。例如，对动漫专业感兴趣的学生可以选择学习相关专业，而对介护福祉学感兴趣的女生则可以选择该专业，传媒学和金融学也是当前热门的专业选择。