留学咨询机构作为一家提供服务的机构，通常需要按照服务业的标准来缴纳税款。以下是留学咨询机构可能需要缴纳的税种和计算方法：

营业税

根据营业额的一定比例缴纳，例如营业额的5%。

增值税

教育咨询属于现代服务业，增值税税率为6%。

企业所得税

根据净利润计算，通常税率为25%，需要扣除各项成本费用后计算。

个人所得税

员工工资薪金所得需缴纳个人所得税，税率根据年收入水平不同而有所区别。

其他附加税

如城市维护建设税、教育费附加和地方教育费附加等。

印花税

根据合同金额的一定比例缴纳，例如注册资金印花税和财产租赁印花税。

具体的缴税方式和计算方法需要根据当地税务机关的规定和留学咨询机构的实际情况来确定。建议咨询当地税务局或专业税务顾问以获得最准确的指导