建都之议过程公元1368年（洪武元年），朱元璋下诏以汴梁为北京，以金陵为南京，效仿周唐的两京故事。
公元1369年（洪武二年），朱元璋又在故乡凤阳营建中都，同时下令从江南移民中都。公元1378年（洪武十一年），朱元璋下诏改南京为京师。公元1368年（洪武元年），朱元璋下诏以汴梁为北京，以金陵为南京，效仿周唐的两京故事。将金陵定为明朝国都。定都应天的主要原因有：天下的税赋多处于东南，而应天则为财赋汇集之地。同时，应天有朱元璋为吴王时期所奠定的宫阙基础；而明朝的开国元勋多为江淮子弟，不愿意轻去他乡。但此后，朝廷对建都之事多有争论。公元1369年（洪武二年），朱元璋又在故乡凤阳营建中都，同时下令从江南移民中都。但是开封和凤阳都是久经战乱，破败不堪，难以承担京师的重任，朱元璋于是放弃了迁都这两处的打算。公元1378年（洪武十一年），朱元璋下诏改南京为京师。至此，建都地点才得以确定，但是为了控制北部边防，朱元璋仍有迁都之念。而南京皇宫是填湖所建。建成之后，由于地表下沉，逐渐形成南高北低的态势，在风水上是不祥的征兆。公元1391年（洪武二十四年），朱元璋派遣太子朱标考察关中地区，为迁都西安作准备。然而第二年朱标病逝，沉重打击了朱元璋，令其不愿再劳师动众地更换京师。一直到洪武朝后期，建都问题仍是朝廷的重要议题。永乐迁都北京后，这一争议才停止。
