港澳通行证1年一次签注和3个月一次签注的不同只在于有效期。

1年一次的有效期是一年，3个月一次的有效期是3个月。

1年一次：指的是本次签注有效期为一年。一年过去,这次签注还没有使用,那么想要使用就必须重新续签才行。1年一次,当在一年之内这一次有效签注已经使用,那么这一次的签注就已经不再能使用。

《港澳通行证》是五年有效期，3个月和一年那是签注时间，只有签注才可以去港澳。

根据规定，年满16周岁，首次办理《港澳通行证》，必须要你本人亲自前往你户口所在地的公安局出入境管理部门办理，这是不能委托他人代办，也不能异地办理的。